Перед началом стимуляции прибор выключен. Пациент занимает положение, необходимое для проведения процедуры (стоя, сидя). Электрод обрабатывается дезинфицирующим раствором (этиловым спиртом, хлоргексидином или др.), затем накладывается на язык поверхностью, содержащей контакты, легко прижимается зубами. Выступающий бортик должен находиться за зубами со стороны полости рта. После этого прибор включается и, с помощью кнопок «+» и «-», подбирается интенсивность воздействия. Критерием является ощущение легкого покалывания на языке. Во время первых нескольких процедур, как правило, отмечается повышенное слюноотделение: это адекватная реакция вегетативных структур нервной системы на воздействие. Нет необходимости снижать интенсивность стимуляции, избыток слюны нужно сглатывать или убирать салфеткой. После третьей — пятой процедуры происходит адаптация к воздействию, и слюноотделение уменьшается.
Во время проведения транслингвальной стимуляции необходимо выполнять упражнения на тренировку тех функций, которые требуется восстановить или улучшить. После окончания процедуры прибор необходимо выключить, электрод извлечь из полости рта, очистить, обработать дезинфицирующим раствором (70% этиловым спиртом, хлоргексидином или др.).